BEP ๊ฐ์ง, ์ฆ ๋๋๋ฌด(Bambusoideae), ๋ฒผ์๊ณผ(Ehrhartoideae), ์กฐ์ ํฌ์ํ์๊ณผ(Pooideae) ๋ฑ์ ๋ฒผ๊ณผ(Poaceae)์ ์ค์ํ ๊ตฌ์ฑ๋ถ๋ถ์ ์ํ๋ค. ์ต๊ทผ ์์ญ๋
๋์ ์ฐ๊ตฌ์๋ค์ ์ด ๋ถ์ผ์์ ๊ฑฐ๋ํ ๋
ธ๋ ฅ์ ์์๋ถ์์ง๋ง BEP ๊ฐ์ง์ ๊ณํต์ ๋ฐ์ก์์ ์ฌ์ ํ ๋
ผ์์ด ๋จ์์๋ค.
๋คํํ ์ต๊ทผ 2๋
๋์ ์ฐ๊ตฌ์๋ค์ ์ฝ๋ก์ฒด(chloroplast) ํ๊ฒ๋ ์์ด ์ ๋ณด๋ฅผ ์ด์ฉํ ๊ฒฐ๊ณผ ๋๋๋ฌด์ ์กฐ์ ํฌ์ํ์๊ณผ๊ฐ ๋์ฑ ๊ฐ๊น์ด ๊ทผ์ฐ์ ์์คํ
๊ด๊ณ๋ฅผ ๊ฐ์ง๊ณ ์๋ค๋๋ฐ ๋ฌด๊ฒ๋ฅผ ๋๊ณ ์๋ค. ๊ทธ๋ฌ๋ ์ฝ๋ก์ฒด ์ ์ ์์ ๊ฒฝ์ฐ, ํธ๋ชจ ์ ์ (๋๋ถ๋ถ ๋ชจ๊ณ ์ ์ )์ด ์ด๋ค์ง๊ณ ์์ด ์๋์ ์ผ๋ก ์งํ ์๋๊ฐ ๋๋ฆฌ๋ฉฐ ๋ ํธ๋ชจ ์ ์ ์ ์ข
(็จฎ)์ ์งํ ์ญ์ฌ๋ฅผ ์ ํํ๊ฒ ๋ฐ์ํ ์ ์๊ธฐ ๋๋ฌธ์ ํต์ ์ ์(nuclear gene, ์์น ์ ์ )๋ฅผ ์ด์ฉํ์ฌ ์ข
์ ์งํ ๊ด๊ณ๋ฅผ ์ฐ๊ตฌํ๋ ๊ฒ์ด ๋งค์ฐ ํ์ํ๋ค.
์ต๊ทผ ์ค๊ตญ ๊ณผํ์ ์ฟค๋ฐ(ๆๆ)์๋ฌผ์ฐ๊ตฌ์ ๊ถ์ ํ(้ญๆฏ่ฏ) ์ฐ๊ตฌ์ง๊ณผ ๋ฆฌ๋์ฃผ(ๆๅพท้) ์ฐ๊ตฌ์ง์ 11๊ฐ ํ๊ฒ๋๊ณผ 6๊ฐ ์ ์ฌ์ฒด(transcriptome)๋ฅผ ๊ฐ์ถ ์ข
์์ด์ ์ด์ฉํ์ฌ ์ข
์ ์งํ์ ๋ํ ์ฐ๊ตฌ๋ฅผ ์ถ์งํ์๋ค. ์ด๋ค ์ฐ๊ตฌ์ง์ ์๋ฌผ์ ๋ณดํ ๋ฐฉ๋ฒ์ ํตํด 17๊ฐ ์ข
์ค 121๊ฐ ์ฑ๊ธ ์นดํผ(single copy) ํน์ ๋ก ์นดํผ(Low copy)์ ์ง๊ณ ๋์ ๊ฒ๋(orthologous groups)์ ์๋ณํด ๋ธ ํ, ์ฌ๋ฌ ๊ฐ์ง ๋ฐฉ๋ฒ์ ์ด์ฉํ์ฌ ๋๋๋ฌด์ ์กฐ์ ํฌ์ํ์๊ณผ๊ฐ ๊ณํต์ ์ธ ๊ด๊ณ์์ ๋์ฑ ๊ฐ๊น์ด ๊ทผ์ฐ ๊ด๊ณ๊ฐ ์๋ค๋ ๊ฒ์ ์
์ฆํ๋ค.
์ฐ๊ตฌ์ง์ ์ง๊ธ๊น์ง ์ฝ๋ก์ฒด ๊ฒ๋๊ณผ ํต๊ฒ๋(nuclear genome) ๋ฐ์ดํฐ๋ฅผ ์ด์ฉํ์ฌ BEP ๊ฐ์ง๊ฐ ๋จ๊ณํต๊ตฐ(monophyletic group)์ด๋ผ๋ ๊ฒ์ ํ์ธํ๋ค. ๋ํ BEP ๊ฐ์ง ๋ด์์ ๋๋๋ฌด์ ์กฐ์ ํฌ์ํ์๊ณผ ๋์ฑ ๊ฐ๊น์ด ๊ทผ์ฐ ๊ด๊ณ๊ฐ ์์ผ๋ฉฐ ๋๋๋ฌด์ ์กฐ์ ํฌ์ํ์๊ณผ๊ฐ ํจ๊ป ๋ฒผ๊ณผ์ ์๋งค๊ตฐ์ ๊ตฌ์ฑํ๋ค๋ ๊ฒ๋ ๊ท๋ช
ํ๋ค.
์ด ์ธ์๋ ์ฐ๊ตฌ์ง์ ๋ฒผ๊ณผ์ 14์ข
์ค 173๊ฒ ์ง๊ณ ๋์ ์ ์ ์๋ฅผ ์๋ณํด ๋์ ๋ฟ๋ง ์๋๋ผ ์ ํ ์๋ ฅ ๋ถ์์ ํตํด ์ด ์ค 9๊ฐ ์ ์ ์๊ฐ ์ง์ ์ ํ(direct selection)์ ํฌ์ธํธ๋ฅผ ๋ณด์ ํ๊ณ ์๋ค๋ ๊ฒ์ ๋ฐ๊ฒฌํ๋ค.
์ด์ ํจ๊ป ์ฐ๊ตฌ์ง์ ์ด๋์ ์จ๋(temperate zone)์ ๋ํ ์ข
์ธ ๋๋์ข
๋๋ง์ฃฝ(dendrocalamus affinis)๊ณผ ๋ชจ์ฃฝ(mao bamboo) ์ค์์ 314๊ฐ ์ง๊ณ ๋์ ์ ์ ์๋ฅผ ์๋ณํ๋ค. ์ด ์ค 24๊ฐ ์ ์ ์์๊ฒ์ ์ง์ ์ ํ ์ถ์ธ๊ฐ ๋ํ๋ฌ๋ค. ๋ง์ง๋ง์ผ๋ก ์ฐ๊ตฌ์ง์ ์ง์ ์ ํ์ ๋ฐ๋ ์ ์ ์์ ๊ธฐ๋ฅ ์ฐ๊ตฌ๋ฅผ ํตํด ์ผ๋ถ ์ ์ ์๋ ํ๊ฒฝ ์๋ ฅ ๋ฐ์, ์์ ๋ฐ์ก, ์ธํฌ ๋ถ์ด, ์ ํธ ์ ๋ฌ, ํธ๋ฅด๋ชฌ ํฉ์ฑ๊ณผ ์ํ ๋์ฌ ๋ฑ ๊ธฐ๋ฅ์ ์ํฅ์ ๋ฐ๋๋ค๋ ๊ฒ์ ๋ฐ๊ฒฌํ๋ค. ์๋ฅผ ๋ค๋ฉด, WCOR413๏ผPM5, Meu13, OsClp8, RRM and DNA-directed RNA polymerase II ๋ฑ์ด๋ค.
๋ณธ ์ฐ๊ตฌ ๊ฒฐ๊ณผ๋ ์ฅ๊ธฐ๊ฐ ๋
ผ์์ด ๋์ด ์๋ ๋ฒผ๊ณผ BEP ๊ฐ์ง ์งํ์์ ์น์ฐ ๊ด๊ณ๋ฅผ ์ ํํ๊ฒ ๊ท๋ช
ํ๋ ๊ณ๊ธฐ๊ฐ ๋๋ค. ๋ฟ๋ง ์๋๋ผ ์ผ๋ถ ์ง์ ์ ํ ์ ์ ์๋ฅผ ๋ฐ๊ตดํจ์ผ๋ก์จ ๋ฒผ๊ณผ์ ์ ์์ฑ ์งํ๋ฅผ ์ดํดํ๋๋ฐ ์ค์ํ ๊ฐ์น๋ฅผ ์ ๊ณตํด์ฃผ๋ฉฐ ๋ ํ์ ์ ์ ์ ๊ธฐ๋ฅ์ ๊ฒ์ฆํ๊ณ ์ ์ ์ ์ ์ด์ ๋ถ์ ์ก์ข
์ ์ฐ๊ตฌํ๋๋ฐ ๊ธฐ์ด ์์ฌ๋ฅผ ์ ๊ณตํด ์ค ๊ฒ์ผ๋ก ์ ๋ง๋๋ค.
ํํธ, ๋ณธ ์ฐ๊ตฌ ๊ฒฐ๊ณผ๋ โPhylogenomic Analyses of Nuclear Genes Reveal the Evolutionary Relationships within the BEP Clade and the Evidence of Positive Selection in Poaceaeโ๋ ์ฃผ์ ๋ก โ๊ณต๊ณต ๊ณผํ ๋์๊ด-์ข
ํฉ(PLoS ONE)โ์ ๋ฐํ๋์์ผ๋ฉฐ ๋ณธ ์ฐ๊ตฌ๋ ์ค๊ตญ ๊ณผํ์ ์ง์ํ์ ๊ณต์ ํ๋ก์ ํธ(KSCX2-YW-N-067), ๊ตญ๊ฐ ์์ฐ๊ณผํ๊ธฐ๊ธ ํ๋ก์ ํธ(30990244), NSFC-์๋ญ์ฑ ์ฐํฉ๊ธฐ๊ธ ํ๋ก์ ํธ(U1136603), ๊ตญ๊ฐ ๊ต์ก๋ถ ๊ท๊ตญ ์ฐ๊ตฌ์ ๊ฐ๋ ๊ธฐ๊ธ๊ณผ ์๋์ฑ ์ฒญ๋
ํ์ ๋ฆฌ๋ ๊ธฐ๊ธ(2008PY065) ๋ฑ์ ์ง์์ ๋ฐ์ ์ํ๋์๋ค.
๊ทธ๋ฆผ: ๋๋๋ฌด, ๋ฒผ๊ณผ์ ์กฐ์ ํฌ์ํ์๊ณผ์ ๊ณํต์ ๋ฐ์ก ๊ด๊ณ๋(PAUP, RAxML, MrBayes์ MP-EST๋ฅผ ์ด์ฉํ์ฌ ๊ณํต ๊ด๊ณ๋ฅผ ํ๋จํ๋ค. ์ํ์ ์์ ์๋๋ ๊ฐ๊ฐ ๋จ๋ฐฑ์ง๊ณผ ํต์ฐ ์์ด์ ๊ธฐ๋ฐํด ์ถ์ ํ ์ง์์จ ) โ*โ์ ์ง์์จ pp=100์ ๋ํํ๋ฉฐ โ#โ์ ์์ ์ 1.0๊ณผ 100์ ์ง์ํ๋ค.
ํค์๋ : BEP ๊ฐ์ง, ๊ทผ์ฐ์ข
, ๋ฒผ๊ณผ,
์ถ์ฒ: KISTI ๋ฏธ๋ฆฌ์ ๊ธ๋ก๋ฒ๋ํฅ๋ธ๋ฆฌํ
์๋ฌธ:
http://www.cas.ac.cn/ky/kyjz/201306/t20130603_3854833.shtml ์ ๊ณต:kisti, ๋ค๋ฅธ๊ธฐ์ฌ๋ณด๊ธฐ๊ธฐ์ฌ๋ฑ๋ก์ผ์ : 2014.02.19 17:21
<์ ์๊ถ์ © ์๋ฎ, ๋ฌด๋จ ์ ์ฌ ๋ฐ ์ฌ๋ฐฐํฌ ๊ธ์ง>
#kisti#